Buenas Tommo, no sé si lo has solucionado ya. Yo uso TTActivator desde linux sin problemas, sólo tienes que instalar el paquete mono (que seguro que está en los repositorios oficiales de tu distribución).
Al descargar TTActivator verás que hay un fichero llamado TTActivator.sh que comprueba que esté instalado mono lo ejecuta con el TTactivator.exe como argumento
Espero que te sirva