No se muy bien como hace la distribución el gps, pero los mapas van por un lado y los pois por otros, tiene limite de almacenaje de pois normalmente un 40% de la MI aprox.

Si quitas un mapa los pois permanecen en el gps pero no guarda la configuración un peñazo.

Para cargar y eliminar los pois o bien lo haces por My Drive si te permite la gestion de los pois (no lo recomiendo)
O bien lo haces vía web (la mejor opción).

Por otra parte, nunca actualices el navcore con MDC, si cambias el navcore fuera de los que pone el manual no podrás parchear el navcore nuevo el parche ttn que aplica MSTMS es exclusivo para los navcore señalados.